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Utilizando un modelo de levadura y un pipeline robótico que generó 90 millones de imágenes 3D de células individuales, este estudio mapea el remodelado del proteoma durante el envejecimiento y revela que los determinantes estructurales biofísicos codifican un principio intrínseco que gobierna la desorganización espacial de las proteínas a lo largo de la vida.
Este estudio utiliza proteómica espacial de una sola célula en levadura para revelar cómo la desorganización espacial de proteínas vincula molecularmente las distintas características del envejecimiento, identificando una secuencia jerárquica de fallos celulares que precede al deterioro general y que es altamente conservada en humanos.
Este estudio demuestra que la suplementación con vitamina D en ratas expuestas al vapeo reduce los marcadores de inflamación y coagulación, disminuye los niveles de nicotina y cotinina, y mitiga parcialmente el daño pulmonar, aunque no elimina completamente la neumonía.
Este estudio retrospectivo en receptores de trasplante cardíaco demuestra que la edad avanzada se asocia con una menor probabilidad de rechazo del injerto y con cambios transcriptómicos específicos en las células inmunitarias que reflejan inmunosenescencia, lo que respalda la necesidad de un enfoque personalizado para la inmunosupresión en una población que envejece.
El marco CELLSWARM demuestra que los agentes celulares impulsados por modelos de lenguaje grande (LLM) pueden no solo replicar con fidelidad la dinámica del microambiente tumoral, sino también generalizar entre diferentes tipos de cáncer, predecir respuestas a tratamientos y detectar perturbaciones genéticas indirectas, superando así las limitaciones de los modelos tradicionales basados en reglas codificadas a mano.
Este estudio demuestra que la activación conjunta de NF-κB mediante señales inflamatorias amplifica la acumulación nuclear de p53 al aumentar su transcripción, lo que altera su dinámica de oscilación a sostenida y, paradójicamente, perjudica la reparación del ADN.
Los autores presentan el agente Web of Microbes, una herramienta autónoma que integra un modelo de clasificación bayesiana, un modelo de crecimiento y un modelo de lenguaje grande para predecir y analizar las preferencias de sustratos microbianos, facilitando así aplicaciones en el cultivo de microorganismos, la ingeniería del microbioma y la microbiología ambiental.
Mediante la integración de perfiles transcriptómicos y lipidómicos, este estudio demuestra que la remodelación de los fosfatidilinositoles, impulsada por redes reguladoras específicas, es fundamental para la diferenciación de los colonocitos y que su alteración en el cáncer de colon conduce a la pérdida de este control y a un aumento del metabolismo de los fosfoinosítidos.
Este estudio demuestra cómo las restricciones físicas del flujo de savia en el xilema moldean programas regulatorios opuestos en los patógenos *Xanthomonas* y *Ralstonia*, permitiéndoles optimizar sus estrategias de multiplicación y diseminación para colonizar eficazmente el mismo nicho ecológico desde diferentes sitios de infección.
Mediante un marco estadístico riguroso aplicado a datos de *Drosophila* y ratones, este estudio valida un modelo de envejecimiento bifásico que revela una transición exponencial al estado "Smurf" seguida de una mortalidad aguda inmediata y una dependencia negativa entre la duración de la fase no-Smurf y la supervivencia posterior.
Este estudio utiliza enfoques multi-ómicos en biopsias renales humanas para revelar que la activación del complemento, impulsada por el factor D, orquesta dinámicas celulares patológicas en podocitos y células epiteliales parietales que conducen a la fibrosis glomerular en la esclerosis glomerular focal y segmentaria, ofreciendo así nuevas perspectivas para intervenciones específicas por etapa.
Este artículo presenta un método versátil de fotolitografía que utiliza reactivos comerciales para crear patrones biomoleculares en dispositivos microfluídicos sellados, permitiendo la modificación de superficies de vidrio y PDMS con diversos cargamentos como ADN, proteínas y nanopartículas de oro para aplicaciones de detección y expresión génica.
Este estudio utiliza la técnica par-seqFISH para demostrar que la decisión entre lisis y lisogenía en bacterias *E. coli* infectadas por el fago lambda surge de la actividad transcripcional individual de cada genoma viral, revelando que la lisogenía requiere un consenso entre los fagos coinfectantes, mientras que las células líticas pueden contener fagos con actividad lisogénica.
El estudio demuestra que la microgravedad acelera el envejecimiento y daña el sistema nervioso de *C. elegans* al reducir la estimulación táctil, pero que reintroducir estímulos mecánicos mediante pequeñas esferas en el medio de cultivo puede mitigar estos efectos adversos.
Este artículo presenta un algoritmo de seguimiento celular mejorado basado en sistemas multiagente abiertos y un filtro de Kalman extendido, capaz de modelar y rastrear con precisión la dinámica, interacciones y linaje de poblaciones celulares heterogéneas en co-cultivos tumorales, superando a las metodologías actuales.
Este estudio analiza durante una década perfiles proteómicos en plasma de adultos de mediana edad para demostrar que los relojes proteómicos específicos de órganos son indicadores dinámicos y estables del envejecimiento biológico que reflejan cambios en factores de riesgo subclínicos, con la menopausia y ciertos medicamentos actuando como moduladores clave de la aceleración del envejecimiento en múltiples sistemas.
Mediante el uso de transcriptómica espacial y de células individuales, este estudio revela que en la enfermedad celíaca los enterocitos adquieren una identidad aberrante caracterizada por la coexpresión de programas zonales debido a la superposición de campos de morfógenos y a la aparición de células metaplásicas, lo que proporciona una visión detallada del remodelado epitelial subyacente a la malabsorción.
Este estudio demuestra que, contrariamente a la creencia de que la degeneración conduce a una evolución neutral, la curvatura de los paisajes de aptitud genera un sesgo direccional que impulsa a las poblaciones hacia regiones más planas y robustas mediante la interacción entre la variabilidad fenotípica y la geometría del paisaje.
Este estudio utiliza un análisis integrativo de cinco capas para demostrar que la diferenciación de etapas en *Leishmania* no se debe a adaptaciones genómicas, sino que está impulsada por mecanismos postranscripcionales, destacando un papel esencial de la degradación de proteínas y la regulación de la traducción en el desarrollo del parásito.
Este estudio demuestra que incorporar la organización espacial intracelular realista, como la geometría de los cromosomas y la traducción asociada al retículo endoplásmico, en modelos de reacción-difusión altera cualitativamente las predicciones sobre la dinámica de la red de galactosa en levadura, destacando la necesidad de superar las suposiciones de entornos bien mezclados en la modelación genética eucariota.